Скопируйте в любое место файл с расширением *.mdb (по умолчанию database.mdb), все ваши данные хранятся именно в нем.

Внимание!!! Если у вас установлена Windows 7 или 8 версии, файл database с вашими данными находится в этой папке: c:\Users\имя пользователя\AppData\Local\VirtualStore\Program Files\Warehouse\database.mdb

А вообще программа Warehouse переустановки не требует, можно переносить целиком папкой на любой компьютер, в т.ч. и после переустановки Windows.